这是一段攻壳机动队成立前夕鲜为人知而又影响深远的故事。2027年6月6日的一天，隶属陆军机密部队501机关的真室中佐（宫内敦士配音）在闹市街头被人杀害，此前他曾陷入军火买卖的贿赂丑闻不得脱身，他对死亡背后自然隐藏着无数疑云。阴雨之夜，试图取回真室电子脑的公安9课课长荒卷大辅（塾一久配音）与生化人草薙素子（坂本真绫配音）在真室中佐的墓地首次相遇。这时草薙还只是501机关负责网络犯罪追查的军人，此行她希望找到倍为尊重的中佐蒙冤以及遇害背后的事实。谁知，棺木中的中佐早已不见了踪影。在此之后，她受到荒卷委托展开调查，并在一连串凶险追查的过程中与前特种部队成员巴特（松田健一郎配音）和时为新滨县刑警的陀古萨（新垣樽助配音）偶遇。难辨兔的雌雄事情错综复杂，难以辨别清楚的案情，草薙一行被引向未知的彼方本片根据士郎正宗的原作改编。大概情节差不多能懂，但是有些细节怎么都不明白啊。我没看过漫画，也不是死忠粉。是不是501原BOSS的死是国防省做的，妓女和巴特队友也是死于国防省，目的是消灭证据和栽赃那个中佐。501方面知情但是无视了，但是把中佐的钱通过素子留下来。不曾想素子和公安九科执意要洗白中佐，结果真相败露。但是，想不明白的地方就在素子宿舍那个自走雷身上，她是谁放到素子身边的，目的又是什么？显然自走雷是那个团伙也就是国防省方面的三个自走雷之一，三个当中一个炸了巴特基友，一个埋在坟上，最后一个炸了大臣。炸基友那个没疑问就是国防省的，埋在坟上的到底是501收缴了中佐那个然后埋的，还是国防省埋的呢？两家都有掩盖真相的动机。如果是国防省埋的，大可完全用自走雷换掉遗体然后处理掉遗体以绝后患没必要留证据在下面，但是如果说是是501埋的，素子屋里那个从哪儿来呢？我一直倾向认为屋里那个是501收缴的那个？但是，目的何在呢？501已经默认让军方处理中佐就不应该让素子插手。屋子里杂乱的涂鸦也不懂，还有究竟是谁有意识的蒙蔽了素子的眼睛？目的何在？关于养母的记忆，究竟501为了转移财产临时安插的，还是一直就有只是被利用了？病毒究竟是有意